Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM4SF4P48230 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TM4SF4P48230 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
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TM4SF4P48230 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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TM4SF4P48230 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TM4SF4P48230 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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TM4SF4P48230 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TM4SF4P48230 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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