Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
B4DXG7 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
B4DXG7 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
B4DXG7 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
B4DXG7 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
B4DXG7 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
B4DXG7 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
B4DXG7 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
B4DXG7 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
B4DXG7 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
B4DXG7 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
B4DXG7 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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