Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms