Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GNEQ9Y223 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms