Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed11Q9D2R4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms