Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP74Q9C0B2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms