Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LIMD2Q9BT23 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LIMD2Q9BT23 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LIMD2Q9BT23 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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