Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins4Q99LZ3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms