Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD6Q96NK8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms