Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx15Q91WE1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms