Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klhl42Q8BFQ9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klhl42Q8BFQ9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms