Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms