Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf4Q6PFF0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf4Q6PFF0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms