Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chd4Q6PDQ2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chd4Q6PDQ2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms