Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CcncQ62447 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcncQ62447 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CcncQ62447 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms