Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbbp7Q60973 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms