Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema5bQ60519 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema5bQ60519 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms