Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD4Q5VX71 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms