Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms