Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf10Q3UIW5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf10Q3UIW5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms