Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk3Q3U3Q1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ulk3Q3U3Q1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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