Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP24-1Q3LI83 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP24-1Q3LI83 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms