Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
QSER1Q2KHR3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
QSER1Q2KHR3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms