Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZFHX3Q15911 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZFHX3Q15911 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms