Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CXCL9Q07325 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms