Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDLBPQ00341 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDLBPQ00341 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms