Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms