Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIRAP54198 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRAP54198 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRAP54198 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRAP54198 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HIRAP54198 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRAP54198 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRAP54198 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRAP54198 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRAP54198 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRAP54198 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRAP54198 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRAP54198 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms