Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ntf3P20181 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ntf3P20181 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ntf3P20181 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ntf3P20181 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ntf3P20181 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ntf3P20181 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ntf3P20181 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ntf3P20181 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ntf3P20181 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ntf3P20181 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ntf3P20181 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ntf3P20181 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ntf3P20181 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms