Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms