Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSD2O96028 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSD2O96028 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NSD2O96028 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NSD2O96028 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NSD2O96028 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NSD2O96028 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NSD2O96028 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSD2O96028 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSD2O96028 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSD2O96028 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms