Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA3O96018 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA3O96018 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA3O96018 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA3O96018 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA3O96018 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APBA3O96018 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APBA3O96018 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APBA3O96018 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APBA3O96018 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APBA3O96018 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA3O96018 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms