Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRTO14522 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRTO14522 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
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