Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slfn8B1ARD8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slfn8B1ARD8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms