Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1Q9Y3L3 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms