Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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