Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
EHD3Q9NZN3 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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