Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCSER1Q9C0I3 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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