Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NUP58Q9BVL2 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NUP58Q9BVL2 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms