Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 APCDD1L-AS1-204ENST00000427794 461 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ST13P2-201ENST00000438916 1109 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GNA14-AS1-201ENST00000439145 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TMEM150C-203ENST00000508701 566 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 PTPN20-228ENST00000513266 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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VAMP3Q15836 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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