| RUNX3 | Q13761 | AC128716.1-201 | ENST00000475129 | 166 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000797.2-201 | ENST00000475768 | 606 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPP1R11P1-201 | ENST00000486095 | 376 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL591P-201 | ENST00000496150 | 292 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC119150.1-201 | ENST00000507143 | 563 nt | TSL 2 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026719.2-201 | ENST00000515656 | 295 nt | TSL 3 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SDCBP-207 | ENST00000520168 | 1097 nt | TSL 2 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008033.2-201 | ENST00000542626 | 177 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC074031.1-201 | ENST00000550634 | 734 nt | TSL 3 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPIAL4F-202 | ENST00000581138 | 660 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPIAL4E-201 | ENST00000581164 | 785 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SRD5A3-AS1-204 | ENST00000592823 | 542 nt | TSL 5 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DARS-AS1-211 | ENST00000595061 | 720 nt | TSL 5 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139124.1-201 | ENST00000609123 | 421 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073575.2-201 | ENST00000614212 | 627 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GOLT1B-210 | ENST00000631252 | 223 nt | TSL 3 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000550.3-201 | ENST00000637734 | 379 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GVQW2-203 | ENST00000641401 | 327 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HTR1F-201 | ENST00000319595 | 3140 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | YTHDC1-207 | ENST00000579690 | 2983 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC232271.1-201 | ENST00000602455 | 2715 nt | BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAPRE2-202 | ENST00000413393 | 4173 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RYR3-208 | ENST00000622037 | 15564 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYBPC1-207 | ENST00000545503 | 3569 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERC1-222 | ENST00000589028 | 9202 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AASDH-210 | ENST00000602986 | 3480 nt | TSL 5 BASIC | 5.35 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLCA1-202 | ENST00000394711 | 3118 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSPA8P14-201 | ENST00000552265 | 1805 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DCN-218 | ENST00000551354 | 2924 nt | TSL 3 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OBSCN-201 | ENST00000284548 | 20432 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC083899.1-201 | ENST00000454465 | 3819 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPN1-205 | ENST00000458167 | 1618 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNF19A-205 | ENST00000519449 | 4330 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF3E-206 | ENST00000519030 | 1324 nt | TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NPSR1-AS1-202 | ENST00000419766 | 4821 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POC1B-201 | ENST00000313546 | 3001 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP95-201 | ENST00000362860 | 303 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP149-201 | ENST00000363008 | 344 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U3.10-201 | ENST00000364459 | 214 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SH3BGR-203 | ENST00000380634 | 816 nt | TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DEFB136-201 | ENST00000382209 | 237 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ST7-204 | ENST00000393444 | 2113 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-64P-201 | ENST00000410795 | 131 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079790.1-201 | ENST00000420365 | 507 nt | TSL 3 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | USP9YP9-201 | ENST00000429406 | 715 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139231.1-201 | ENST00000431001 | 312 nt | TSL 3 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590399.4-201 | ENST00000436561 | 601 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL591719.2-201 | ENST00000437400 | 386 nt | TSL 3 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016292.1-201 | ENST00000438344 | 235 nt | TSL 3 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096644.1-201 | ENST00000446169 | 390 nt | TSL 3 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEPT14P1-201 | ENST00000458703 | 648 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL860P-201 | ENST00000473738 | 223 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL244P-201 | ENST00000493405 | 297 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC109439.2-201 | ENST00000502421 | 564 nt | TSL 4 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02039-201 | ENST00000507428 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108043.1-201 | ENST00000512696 | 574 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004052.1-201 | ENST00000514327 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP67-201 | ENST00000515905 | 235 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PMP2-202 | ENST00000519260 | 1264 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4A17P-201 | ENST00000526032 | 904 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002765.2-201 | ENST00000532961 | 666 nt | TSL 3 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02313-201 | ENST00000553330 | 550 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PDCD6IPP2-207 | ENST00000566321 | 1069 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4691-201 | ENST00000583764 | 85 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL162431.4-201 | ENST00000604674 | 411 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356752.1-201 | ENST00000615844 | 593 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087385.3-201 | ENST00000620477 | 187 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099654.6-201 | ENST00000636487 | 512 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNRD1ASP-221 | ENST00000637794 | 1074 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ASAH2-202 | ENST00000395526 | 6880 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01206-204 | ENST00000482787 | 9580 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR10G7-202 | ENST00000641585 | 3449 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ENKUR-201 | ENST00000331161 | 3382 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ACSL5-202 | ENST00000354655 | 3351 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MATR3-230 | ENST00000394800 | 5513 nt | TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC100757.1-201 | ENST00000616872 | 1835 nt | BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DAZ4-207 | ENST00000634662 | 1832 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ABI2-204 | ENST00000295851 | 22209 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.55 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPALPP1-201 | ENST00000357537 | 5368 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NRG3-202 | ENST00000372142 | 3136 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRIT3-201 | ENST00000327908 | 3781 nt | TSL 2 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDC42BPA-201 | ENST00000334218 | 10134 nt | TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TXK-201 | ENST00000264316 | 2914 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SETD2-202 | ENST00000409792 | 8142 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.34 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC245100.4-204 | ENST00000635587 | 1555 nt | TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFAP61-201 | ENST00000245957 | 4082 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006206.1-201 | ENST00000544842 | 3387 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR51G2-202 | ENST00000641926 | 3326 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NR3C2-202 | ENST00000344721 | 5712 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF534-202 | ENST00000332323 | 2086 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GSTM2-206 | ENST00000442650 | 1478 nt | TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IL1RAPL1-202 | ENST00000378993 | 3667 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DOCK4-AS1-201 | ENST00000452714 | 2494 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DPY19L2P2-203 | ENST00000435536 | 1858 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADCY10-201 | ENST00000367848 | 5055 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PDE4D-216 | ENST00000507116 | 3350 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007996.1-201 | ENST00000620414 | 2821 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAX-203 | ENST00000341653 | 330 nt | TSL 2 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01317-201 | ENST00000366209 | 779 nt | TSL 5 BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353625.1-202 | ENST00000366273 | 571 nt | BASIC | 5.33 | □□□□□ -1.56 | | |