Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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TOP3AQ13472 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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TOP3AQ13472 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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