Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms