Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GRIK2Q13002 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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