Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTP4A2Q12974 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.8 ms