Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
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