Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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HOXD10P28358 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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HOXD10P28358 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
HOXD10P28358 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
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