Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GDAP2Q9NXN4 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms