Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC006387.1-203ENST00000494849 342 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 LINC02034-201ENST00000635368 760 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AL049844.3-201ENST00000454207 1496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PHACTR1Q9C0D0 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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