Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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RAB6CQ53S08 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RAB6CQ53S08 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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